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Application des techniques moléculaires de PCR-RFLP et de PCR-RFLP-SSCP dans l'étude de la différenciation génétique de deux huîtres creuses : Crassostrea gigas et Crassostrea angula ArchiMer
Dufourg, Cecile.
Les 2 taxons d'huîtres creuses C. angulata et C. gigas n'étant pas différenciables sur des critères morphologiques, écologiques ou physiologiques, l'étude de leur passé évolutif fait appel à l'utilisation de marqueurs génétiques. L'étude du polymprohisme des séquences mitochondriales codant pour la sous-unité I de la cytochrome oxydase par la technique de PCR-RFLP a été réalisée sur 197 individus appartenant à 5 populations d'origine géographique différente, de type Crassostrea angulata ou Crassostrea gigas. Elle a permis la construction d'un arbre représentant les relations phylogénétiques entre ces populations. Cet arbre a été comparé à celui établi à partir de l'analyse de 3 marqueurs microsatellites. Les résultats de ces 2 analyses sont similaires et...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea angulata; Crassostrea gigas; Génétique; Polymorphisme; ADN; SSCP; Biologie moléculaire.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14415/11709.pdf
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Caractérisation moléculaire des parasites du genre Mycrocytos ArchiMer
Moreau, Dimitri.
Les différentes productions ostréicoles mondiales sont à l'heure actuelle sérieusement mise à mal par différentes épizooties. Les responsables majeurs de ces maladies, sont des parasites protozoaires. Deux espèces sont responsables de la Bonamiose, une en Europe, Bonamia ostrea et une en Nouvelle Zélande et en Australie, Bonamia sp.. Deux autres parasites provoquent des maladies différentes : Mikrocytos roughleyi qui sévit en Australie et Micrkorcytos mackini au Canada. Ces quatre espèces infectant des zones différentes ne doivent en aucun cas venir coloniser des régions ou pays indemnes. C'est pourquoi il est important de pouvoir arriver à identifier leur présence chez un hôte le plus rapidement possible. Ces protozoaires étant assez proches...
Tipo: Text Palavras-chave: Biologie moléculaire; Parasite; Mikrocytos roughleyi; Phylogénie.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14353/11637.pdf
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Développement et utilisation des marqueurs génétiques hypervariables chez les espèces marines. Rapport de synthèse 1995-1998 ArchiMer
Bonhomme, Francois; Gerard, Andre.
L'objectif scientifique de l'Unité de Recherche Marine n0 16 est de partager les savoir faire conceptuels et méthodologiques des deux équipes, pour faire aboutir des programmes appliqués ou fondamentaux dans le domaine de la génétique des organismes marins. Ces programmes concernent plus particulièrement le développement et l'utilisation des marqueurs génétiques fournis par les techniques de biologie moléculaire dans les programmes suivants: Chez les huîtres des genres Ostrea et Crassostrea : Le modèle prioritaire de l'URM sera les huîtres Crassostrea et Ostrea. Pour des raisons historiques, les recherches sur Ostrea sont plus avancées et donneront des résultats plus rapidement. 1-Sélection assistée par marqueurs chez Ostrea edulis et Crassostrea gigas...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Marqueur génétique; Biologie moléculaire; Sélection génétique; Ressource génétique; Recrutement; Bivalvia; Crassostrea; Ostrea; Pisces; Dicentrarchus labrax; Génotypage.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15459/12834.pdf
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Essais de caractérisation moléculaire des parasites du genre Marteilia (Phylum Paramyxea) à l'aide de l'ADNr ArchiMer
Rodriguez, David.
Les parasites du genre Marteilia sont responsables de graves épizooties et sont retrouvés dans une communauté très variable de mollusques bivalves marins. Toutefois ces protistes restent difficiles à classer à l'intérieur du genre du fait que les données morphologiques sont insuffisantes pour distinguer avec précision deux espèces données. Ceci est le cas pour Martilia refringens, affectant l'huître plate Ostrea edulis ou la moule (Mytilus edulis et Mytilus galloprovincialis), Marteilia sp. et Marteilia maurini affectant les deux espèces de moules. C'est pourquoi, nous avons tenté d'isoler, par PCR, le gène codant pour l'ARN 18S, les ITS1 et ITS2 ainsi que le gène codant pour l'ARN 5,8S des parasites présents chez l'huître plate et la moule (M. edulis),...
Tipo: Text Palavras-chave: Parasite; Marteilia; PCR; Ostrea edulis; Mytilus edulis; Biologie moléculaire.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14352/11636.pdf
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Etude des facteurs de transcription impliqués dans l’accumulation lipidique en condition de stress azoté chez la microalgue haptophyte Isochrysis affinis galbana ArchiMer
Thiriet-rupert, Stanislas.
In every organism, evolution and acclimation to environmental changes are orchestrated by numerous molecular players. Among them, transcription factors (TFs) play a crucial role by regulating gene expression. Therefore, identify TFs involved in the production of high value products is a significant step in a biotechnological context. The laboratory has at its disposal a mutant strain of the haptophyte microalga Tisochrysis lutea producing twice more storage lipids than the wild type strain when exposed to nitrogen deprivation. Given the key role of TFs in phenotype establishment, this PhD aim at identify the TFs involved in that of the mutant phenotype of T. lutea. A TFs identification and classification pipeline was elaborated and applied to T. lutea’s...
Tipo: Text Palavras-chave: Bioinformatique; Biologie moléculaire; Évolution; Facteur de transcription; Micro-algue; Réseau de gènes; RNA-seq; Bioinformatic; Evolution; Gene network; Molecular biology; Microalgae; RNAseq; Transcription factor.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00371/48233/48368.pdf
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La bonamiose un fléau de l'huître plate.... ArchiMer
Morga, Benjamin.
The history of French oyster culture shows very well how fragile this farming is to stock overexploitation and diseases. The production of flat oyster, Ostrea edulis, fell dramatically after the appearance of two parasitic diseases: arteiliosis and bonamiosis. The curative means against bonamiosis (Bonamia ostreae) are restricted and imply a good knowledge of the parasite's life cycle and of its interaction with its host. Studying the expression of the parasite's and the host's genes during the infection seems essential in providing new adapted measures in order to maintain, if not relaunch the flat oyster culture. In this context, this thesis aims to understand the flat oyster-parasite interactions, and especially, the molecular basis of the resistance to...
Tipo: Text Palavras-chave: Biologie moléculaire; Gene; Parasite; Huîtres; Ostrea edulis.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3369.pdf
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Optimisation du diagnostic et épidémiologie de la maladie de l'anneau brun sur la côte Atlantique ArchiMer
Beguier, Jeremy.
A l'échelle nationale, la conchyliculture a connu des épizooties catastrophiques ; l'huître portugaise (Crassostrea angulata) a disparu des côtes françaises, suite à des infections impliquant des iridovirus. L'huître plate (Ostrea edulis) a vus sa production fortement réduite suite à l'introduction de deux maladies parasitaires, la bonamiose et la marteiliose. La maladie de l'anneau brun, maladie d'origine bactérienne due à Vibrio tapetis a engendré depuis 1987 en Europe des mortalité allant de 60 à 80% dans les élevages, écloseries et bancs naturels de palourdes japonaises Ruditapes philippinarum et de palourdes européennes R. decussatus, compromettant le développement de cette filière aquacole. Cette étude a pour but d'obtenir une image de la maladie de...
Tipo: Text Palavras-chave: Palourdes; Ruditapes philippinarum; Ruditapes decussatus; Anneau brun; Vibrio tapetis; Biologie moléculaire.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14480/11780.pdf
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Pipetman et bottes en caoutchouc à la recherche d'hôte(s) de Marteilia refringens ArchiMer
Audemard, Corinne; Le Roux, Frédérique; Sauriau, Pierre-guy; Sautour, Benoît; Combes, C.; Coustau, C.; Blachier, Philippe; Berthe, Franck.
Over the last thirty years, the French production of flat oyster Ostrea edulis dropped from15,000 tons/year to 1,500 tons. Marteilia refringens, a parasite of the flat oyster's digestive gland, is partly responsible for this drop. The fight against this pathogen agent requires a better knowledge of its parasitic cycle. The main hypothesis is the existence of a heteroxenous cycle, that is to say a cycle involving more than one host. However, for thirty years this or these hosts have not been found, and the cycle of Marteilia refringens remains unknown.
Tipo: Text Palavras-chave: Claires ostréicoles; Parasite; Détection; Biologie moléculaire; Marteilia refringens.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3272.pdf
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Rapport d'activité 1990 de l'Unité de Recherche en Pathologie Immunologie et Génétique Moléculaire (URPIGM) ArchiMer
Mialhe, Eric.
Rapport d'activité 1990 de l'Unité de Recherche en Pathologie Immunologie et Génétique Moléculaire (URPIGM) La Tremblade
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Immunologie; Biologie moléculaire; Invertebres marins; Rapport activité.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00072/18283/15853.pdf
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Rapport final : mise au point de cultures cellulaires de mollusques marins ArchiMer
Grizel, Henri.
Le problème majeur allant à l'encontre du développement de l'aquaculture dans le monde, en particulier pour l'élevage des mollusques, est lié à des maladies infectieuses. Les agents responsables sont essentiellement des parasites et des microorganismes intracellulaires. Les données acquises en pathologie des mollusques sont à l'heure actuelle en majorité descriptives, mais compte tenu de l'impact économique de ces maladies, des recherches doivent être développées pour élaborer des mesures prophylactiques et thérapeutiques. Dans cette optique l'établissement de lignées cellulaires de mollusques marins constitue une priorité car, à l'instar des lignées cellulaires de vertébrés utilisées en pathologie humaine et vétérinaire, elles permettraient la production...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Culture cellulaire; Biologie moléculaire; Agent pathogène; Primoculture; Ostrea edulis.
Ano: 1986 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/15978/13420.pdf
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